Bizonytalan, változó politikai helyzetben, maroknyi elszánt, elkötelezett ember az Iskolaszék Egyesületbe tömörülve, 1989-1990 között szervezte meg az Ökumenikus Iskolát. Hagyományok nélkül, azonban az első perctől fogva maradandó hagyományokat teremtve. A szülők, tanárok lelkesedése, kitartása a temérdek nehézség ellenére töretlen maradt. Akik időközben elmentek, itt hagyták szellemi, lelki "csomagjaikat", az újak pedig megértve, elfogadva és alkalmazva pedagógiai programunk alapvetéseit, tudásukkal, egyéniségükkel folyamatosan színesítették a palettát az egyre növekvő Iskolában. A lelkes iskola alapító csapat Az Ökumenikus Iskola a négy és fél tantermes Kossuth utcai épületben nyitotta meg kapuit 1990. szeptember 1-én Kőszeghy Tamásné Mária igazgatónő vezetésével és a Galamb Gáborné Lívia néni, Kecskés Anita, Molnár Emese, Suda Gábor és Vígh Krisztina alkotta tanári karral. Az elkövetkezendő években mindig két új első osztállyal bővült az Iskola. Tudtuk, hogy ez az épület hamarosan szűk lesz számunkra. Folyamatos bővítések és átépítések következtek, melyekhez nagyon sok nemzetközi szervezett adott segítséget. Végül az Önkormányzattal folytatott hosszas tárgyalások eredményeként és egy helycsere segítségével 1994-1995-ben vadonatúj, korszerű, nívódíjas iskola épült számunkra a közeli Községház utcában, Kiss Attila építészmérnök tervei alapján. Tízévnyi állami fenntartást követően 2020. szeptemberétől a Pannonhalmi Bencés Kongregáció vette át iskolánk fenntartói feladatokat, melynek neve ettől kezdve Pannonhalmi-Főapátság Máriaremete-Hidegkúti Ökumenikus Általános Iskola lett.